酵素菌是由細菌、酵母菌、和絲狀真菌組成的好氧性有益微生物菌群，簡稱為BYM。據酵素世界社、日本島本微生物工業株式會社提供的資料，酵素菌含有24種有益微生物。根據研究所多年來的研究分析總結歸納后，酵素菌的優勢功能菌主要包括：釀酒酵母、酵清酒假絲酵母、接合酵母、粉狀畢赤酵母、枯草芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌、巨大芽孢桿菌、植物乳桿菌、曲霉、根霉等（其他名稱因產權關系不便公開）。

 

　　1、釀酒酵母   又稱為啤酒酵母，酒精酵母或漢遜酵母。該菌有良好的發酵性能，能產生醇類物質。菌體維生素，蛋白質含量高。該菌的代謝產物中含有核酸、谷胱甘肽、輔酶A、三磷酸腺苷（ATP）、維生素、泛酸、硫胺素、吡哆醇和肌醇等。

 

　　2、枯草芽孢桿菌   該菌的代謝物中含有多種激素和酶類。主要作用是：產生聚麩氨酸類物質，為土壤的保護膜，有效防止養分、水分的流失；產生高活性分解酶，將難分解的大分子物質分解為可利用的小分子物質，合成多種有機酸、酶、生理活性物質等及其他被利用的養分；占據空間，競爭食物，抑制有害菌、病原菌等的生長繁殖。

 

　　3、巨大芽孢桿菌   該菌具有降解土壤中有機磷的功能。減少化肥施用量；促進作物生長，預防病害；改良土壤，恢復生態平衡；提高農產品品質，將它使用到煙葉上，煙葉發酵增香效果獨特。該菌耐高溫，長期保存不失活。

 

　　4、地衣芽孢桿菌   該菌的主要作用：代謝產物中含有一些抑菌物質，能抑制土壤中病菌的繁殖和對植物根部的侵襲，減少植物土傳病害，預防多種害蟲爆發；提高種子的出芽率和保苗率，預防種子自身遺傳病害，提高作物成活率，促進根系生長；改善土壤團粒結構，改良土壤，提高土壤蓄水、蓄能能力，有效增高低溫，緩解重茬障礙；促使土壤中的有機物分解后再合成腐殖酸，極大地提高土壤肥效；促進作物生長，促進作物早熟。

 

　　5、植物乳桿菌   該菌能產生乳酸和二氧化碳。用于種植業、畜牧水產養殖。有一定的免疫調節作用，對致病菌有抑制作用，能降低血清膽固醇含量和預防心血管疾病、維護腸道內菌群平衡，促進營養物質吸收、緩解乳糖不耐癥抑制腫瘤細胞的形成等。

 

　　6、米曲霉    該菌繁殖速度快，抗雜菌能力強，糖化力和產乳酸能力都很強。代謝產物中含有蛋白酶、纖維素酶、淀粉酶等。生產中在原料中加入麩皮有利于氨基酸的形成。（注：由于產權關系，24種有益微生物不能公開。）